Le programme de base en MMT est un baccalauréat spécialisé en médecine moléculaire et translationnelle (Bacc. spécialisé). Ce programme offre des possibilités d'apprentissage actif et expérimental dans le domaine des sciences biomédicales. Le programme de MMT permet également aux nouveaux étudiants de s'inscrire à un programme intégré BSc-MSc ou BSc-PhD à la Faculté de médecine. Ce programme intégrera les projets de recherche d'été et de 4ème année au premier cycle dans les travaux de thèse des études supérieures. Les étudiants admis dans ce nouveau programme intégré complèteront leur programme d’études supérieures plus rapidement : la durée du programme B.Sc.-M.Sc. sera de 5 ans (2 ans de premier cycle, 2 ans de MMT, un an d'études supérieures) et celle du B.Sc.-Ph. D. sera de 8 ans (2 ans de premier cycle, 2 ans de MMT, 4 ans d'études supérieures).