Élaboration de modèles, d’algorithmes et de procédures d’induction statistique pour procéder à l’analyse comparative de différents génomes. Professeur Sankoff utilise les approches mathématiques pour étudier les gènes et les génomes. Les projets qu’il entreprend visent à étendre ce domaine sur plusieurs fronts, incluant la modélisation probalistique de l’évolution des bactéries, des protistes et des organismes supérieurs; et les conséquences de différents mécanismes, tels que la translocation et l’inversion chromosomiques et la duplication génique et génomique, sur l’évolution de l’ordre génique.
Publications sélectionnées
- Casesnoves Ferrer, R., D. Sankoff, and M.T. Turell. Linguistic shift and community language: the effect of demographic factors in the Valencian Region, Balearic Islands and Catalonia. Globalization and Language in the Spanish-speaking World (C. Mar-Molinero & M. Stewart, eds.) Palgrave Macmillan, 197-219, 2006
- Zheng, C. Q. Zhu, and D. Sankoff. Removing noise and ambiguities from comparative maps in rearrangement analysis. Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2007
- Xu, W., C. Zheng, and D. Sankoff. Paths and cycles in breakpoint graphs of random multichromosomal genomes. Journal of Computational Biology 14, 2007
- Adam, Z., M. Turmel, C. Lemieux, and D. Sankoff. Common intervals and symmetric difference in a model-free phylogenomics, with an application to streptophyte evolution. Journal of Computational Biology 14, 2007
- Sankoff, D. and C. Zheng Q. Zhu. Polyploids, Genome Halving and Phylogeny. Bioinformatics, 2007
Étudiants et chercheurs postdoctoraux supervisés
- Étudiants aux 2e et 3e cycles :
- Jamshidpey, Arash (co-supervisé avec Donald Dawson)
- Larlee, Caroline Anne
- Meghdari Miardan, Mona
- Yu, Zhe
- Zhang, Yue
- Chercheurs Postdoctoraux:
- Zheng, Chunfang
Groupe de recherche
- Statistique et probabilité